Το κυρίως πιάτο της 3ης φάσης του Κυπέλλου Ελλάδας διεξήχθει το απόγευμα της Τετάρτης (13/9).
Αναλυτικά τα αποτελέσματα:
Τετάρτη 13 Σεπτεμβρίου
Πανθρακικός - Εθνικός 0-1 (29' Αντωνίου). Διεκόπη στο 43'
Απόλλων Παραλιμνίου - Αλεξανδρούπολη 3-0 (8'-35' Παναγιωτόπουλος/57' Κατσαμάγκας)
Μακεδονικός - Αιγάλεω 0-4 (28'-69' Νταβιώτης, 72' Ζυγκερίδης, 90+4' Μαραθωνίτης)
Ηλιούπολη - Λεβαδειακός 1-2 (112' Μάντιτς/92'-118' Κουϊρουκίδης)
Αστέρας Σταυρού - Γιούχτας 1-3 (37' Φράγκος/9' Πολυχρόνης, 60' Ροβίθης, 66' Κίσσας)
ΑΟ Χανιώτης - Τηλυκράτης 0-1
Παναργειακός - Παμβουπρασιακός 3-4 πεν (1-1 κ.δ. 60' Πρίκας/43' Μπίσα)
Ιωνικός - Athens Kallithea 0-3 (14'-60' Λουκίνας, 19' Ματίγια)
ΟΦ Ιερέπατρας - Καμπανιακός 0-3 (α.α.)
Αχαρναϊκός - Παναχαϊκή 3-2 πεν. (0-0 κ.δ.)
Κοζάνη - Ηρακλής (Αναβλήθηκε)
Κυριακή 17 Σεπτεμβρίου
Χανιά - Απόλλων Πόντου (16:00)
Αιολικός - Αναγέννηση Καρδίτσας (16:00)
Τετάρτη 20 Σεπτεμβρίου
Ζάκυνθος - Νίκη Βόλου (16:00)
Προκρίνονται άνευ αγώνα στην τέταρτη φάση
Καλαμάτα
Πιερικός
Μικρασιατικός
Διαγόρας
Αλμωπός Αριδαίας
ΑΕΛ