Ο Πανσερραϊκός ιδρύθηκε στις 31 Μαΐου του 1964 οπότε και αποφασίστηκε επισήμως η συγχώνευση δύο σερραϊκών ομάδων της Β' Εθνικής κατηγορίας, του Απόλλωνα Σερρών και του Ηρακλή Σερρών.
