Το τμήμα ποδοσφαίρου του Παναιτωλικού Γ.Φ.Σ. δημιουργήθηκε το 1926. Θεωρείται ένας από τους ελληνικούς συλλόγους με τους πιο πιστούς φιλάθλους. Τόσο στους αγώνες που γίνονται στο ιδιόκτητο γήπεδό του, στο κέντρο του Αγρινίου που σχεδόν σε όλους είναι κατάμεστο, όσο και στους εκτός έδρας (κυρίως αυτούς της Αθήνας), σταθερά η ποδοσφαιρική ομάδα έχει στο πλευρό της πάρα πολλούς υποστηρικτές της.
